Священномученик Николай Попов родился 6 мая 1864 года в семье статского советника Черкасской станицы Войска Донского Харитона Ивановича Попова и дочери священника станицы Мигулинской Александры Петровны. У Харитона Ивановича и Александры Петровны было девять детей: четыре сына — Николай, Петр, Александр, Иван и пять дочерей — Неонилла, Серафима, Мария, Ольга